Действие фильма разворачивается в последние месяцы Второй мировой войны и сразу после её окончания, когда Япония лежит в руинах, а жители пытаются собрать по кусочкам разорванную войной жизнь. Главный герой — Коити Сикисима, молодой пилот камикадзе, который выжил после того, как был вынужден посадить свой самолёт на маленьком острове в Тихом океане.
Действие разворачивается в 1614 году, когда Япония только объединилась под властью первого сёгуна Токугавы Иэясу, и старые раздоры между кланами ниндзя не угасли даже после установления единого правления. Клан Кога и клан Ига связывала многовековая вражда, которая привела к почти полному уничтожению обоих сообществ, и теперь их выживание зависит от двух молодых воинов — Генносукэ из Кога и...