История начинается с того, что после трагической гибели жены и всех своих потомков, кроме одного, рыба-клоун Марлин живет в коралловом рифе вместе с сыном Немо, который родился с укороченным плавником. Осторожный до паранормальности отец всеми силами оберегает подростка от любых опасностей открытого океана, но любопытный Немо хочет доказать, что он уже взрослый и способен сам заботиться о себе.
