20 лет прошло после той самой эпической битвы в Метро-Сити, в которой Самаритянин уничтожил могущественного суперзлодея Нефеара. По официальной версии, оба погибли во время взрыва, но среди жителей города до сих пор ходят слухи, что герой просто решил скрыться, устав от постоянной ответственности и ожиданий людей.
Действие ленты разворачивается в 2524 году, когда человечество уже несколько веков успешно осваивает отдаленные уголки космоса, создавая стабильные колонии на десятках планет. Но долгий период относительного спокойствия заканчивается внезапно: на границах освоенного пространства появляется неизвестная враждебная раса, чьи корабли без предупреждения атакуют человеческие поселения, уничтожая все...